CSGraph代表压缩稀疏图,它着重于基于稀疏矩阵表示的快速图算法。
首先,让我们了解一个稀疏图是什么以及它在图表示中的作用。
图形只是节点的集合,它们之间有链接。 图表几乎可以代表任何事物 - 社交网络连接,每个节点都是一个人,并且与熟人相连; 图像,其中每个节点是像素并连接到相邻像素; 指向高维分布,其中每个节点都连接到最近的邻居,并且几乎可以想象其他任何事物。
一个具体的例子,假设想要表示无向图,如下所示 -
该图有三个节点,其中节点0
和1通过权重2
的边连接,节点0
和2
通过权重1
的边连接。可以构造如下例所示的稠密,掩码和稀疏表示 请记住,无向图由对称矩阵表示。
G_dense = np.array([ [0, 2, 1], [2, 0, 0], [1, 0, 0] ]) G_masked = np.ma.masked_values(G_dense, 0) from scipy.sparse import csr_matrix G_sparse = csr_matrix(G_dense) print (G_sparse.data)
上述程序将生成以下输出。
array([2, 1, 2, 1])
这与前面的图相同,只是节点0
和2
通过零权重的边连接。 在这种情况下,上面的密集表示会导致含糊不清 - 如果零是一个有意义的值,那么如何表示非边缘。 在这种情况下,必须使用蒙版或稀疏表示来消除歧义。
看看下面的例子。
from scipy.sparse.csgraph import csgraph_from_dense G2_data = np.array ([ [np.inf, 2, 0 ], [2, np.inf, np.inf], [0, np.inf, np.inf] ]) G2_sparse = csgraph_from_dense(G2_data, null_value=np.inf) print (G2_sparse.data)
上述程序将生成以下输出。
array([ 2., 0., 2., 0.])