要配置Nginx服务器，只允许网站根目录下的 index.php 文件执行而禁止其他 PHP 文件执行，可以通过 Nginx 的 location 配置和 fastcgi_split_path_info 指令来实现。以下是可能的配置示例：

server {
    listen 80;
    server_name your_domain.com;
    root /path/to/your/root;

    index index.php;

    location / {
        try_files $uri $uri/ /index.php?$query_string;
    }

    location ~ \.php$ {
        fastcgi_split_path_info ^(.+\.php)(/.+)$;
        fastcgi_pass unix:/run/php/php7.4-fpm.sock;
        fastcgi_index index.php;
        include fastcgi_params;

        # 只允许根目录的 index.php 文件执行
        if ($document_uri ~ ^/index\.php$) {
            # 执行 PHP 文件
            # 可以根据实际情况添加其他配置
        }

        # 其他情况禁止执行
        if ($document_uri !~ ^/index\.php$) {
            return 403;
        }
    }

    # 其他配置
}

在以上配置中，根据不同的文件路径来限制执行权限。location / 块用于处理所有非 PHP 文件的请求，并尝试读取对应的文件或将请求传递给 index.php 文件。location ~ \.php$ 块用于处理 PHP 文件的请求。

在 location ~ \.php$ 块中，通过设置 if 条件来限制只有根目录下的 index.php 文件可以执行，并且其他 PHP 文件会返回 403 禁止访问。请根据实际情况替换示例中的 PHP-FPM 配置和根目录路径。配置完成后，重新加载 Nginx 配置使其生效。

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