Linux教程

LINUX下基于NVIDIA HPC SDK 的 VASP6.3.x编译安装报错整理

本文主要是介绍LINUX下基于NVIDIA HPC SDK 的 VASP6.3.x编译安装报错整理,对大家解决编程问题具有一定的参考价值,需要的程序猿们随着小编来一起学习吧!
  • 关于gcc

    • 用旧版本安装NVIDIA HPC SDK再编译会报错:

      • "/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/include/c++/8/bits/move.h", line 48: error: identifier "__builtin_addressof" is undefined

      • 解决办法:

        • 升级gcc

        • 重新安装NVIDIA HPC SDK。先前安装的可以删除(rm -rf 文件夹)。安装NVIDIA HPC SDK时,可以指定路径,在提示是否安装在默认的文件下时,输入自己计划安装的绝对路径。

    • 在准备编译环境时最好检查gcc版本

      • gcc --version

      • 如果比较老,需要升级。我是在gcc10.x这个版本下编译通过的。

  • 动态库缺失:我缺失 libatomic.so.1 ,每个人可能不一样但解决办法类似以下两种。

    • 通过安装,安装时要注意64位与32位。

    • 在别的地方拷贝。(推荐此方法)

  • 关于编译环境

    • 说明:所有需要编译安装的软件,编译前都要先准备配置好编译环境。后面编译报错,大概率就是编译环境有问题。所以,编译报错,找问题要找编译环境的问题。

    • NVIDIA HPC SDK安装

      • 官网(推荐按官网步骤):https://developer.nvidia.com/nvidia-hpc-sdk-downloads

        • 建议采用Tarball方式安装,可以指定安装路径。且安装完有环境配置说明。

        • 安装命令:
          $ wget https://developer.download.nvidia.com/hpc-sdk/22.5/nvhpc_2022_225_Linux_x86_64_cuda_multi.tar.gz
          $ tar xpzf nvhpc_2022_225_Linux_x86_64_cuda_multi.tar.gz
          $ nvhpc_2022_225_Linux_x86_64_cuda_multi/install
        • 安装完一定要添加环境变量:

          • 建议采用module命令: module load /.../..../.../modulefiles/nvhpc/22.5(用自己的安装路径)

          • 也可用官网说明:https://docs.nvidia.com/hpc-sdk/hpc-sdk-install-guide/index.html#install-linux-end-usr-env-settings

    • FFTW安装:http://www.fftw.org/

      • 推荐按官网说明安装。

      • 参考教程:https://nscc.mrzhenggang.com/fftw/

  • 准备好这一切,再编译VASP就应该能通过。几个VASP安装说明网址,强烈推荐按VASP官网说明安装使用。网上的编译安装教程可以参考,因为每个手头的机器环境是千奇百怪的,所以按官网来是最明智,可以少走很多弯路!

    • VASP官网安装说明:https://www.vasp.at/wiki/index.php/Installing_VASP.6.X.X

    • VASP环境要求说明:https://www.vasp.at/wiki/index.php/Toolchains

    • VASP各个makefile.include说明:https://www.vasp.at/wiki/index.php/Makefile.include

    • VASP安装使用官网论坛:https://www.vasp.at/forum/viewforum.php

  • 祝福好运,使用愉快!

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